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首先，为了迅速查明致病菌，必须在选用抗生素前先做细菌培养和药敏试验，如果在用过抗生素后才做细菌培养和药敏试验，将难以获得阳性结果，进而难以进一步有的放矢地治疗。据报道，在选用敏感抗生素治疗血培养阳性的61例败血症患者中，采血标本后两天内，有35例患者选用的抗生素是对致病菌敏感的，另26例选用的抗生素不敏感，后一组在5天内即有35%死亡，最后生存率前者为65.7% ，而后者为42.3%，说明选用敏感的抗生素的重大意义。
但是，细菌培养和药敏试验至少需要48小时才能出结果，在实际工作中，用药不可能也无必要等待细菌培养结果，因此，临床上第一步要做的工作就是尿沉渣涂片找细菌，迅速确定是杆菌感染还是球菌感染，进而选择出基本对路的抗生素。另外，由于一般尿路感染多由大肠杆菌等革兰氏阴性菌引起，因此，在无上述结果时可选用对革兰氏阴性菌有效的抗菌素。在治疗 72小时后，如症状无改善，可根据已出的细菌培养和药敏试验结果调整用药；如已奏效，则不必改药，因为体内药效试验效果远较体外试验为好。一般体外药敏试验结果和临床效果符合率仅为75%～80%，药敏治疗效果常常受菌种和有无尿路梗阻等多种因素的影响。有文献报告，细菌消灭率在尿路梗阻者为54%，而无梗阻者为82%，至于复杂的尿路感染或在医院获得的尿路感染，耐药菌株较多，变形杆菌、绿脓杆菌等对多种药物耐药，常需根据药效选择抗生素。
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